Manitas Delmonte, un narcotraficante mexicano, decide someterse a una operación de cambio de sexo para convertirse en mujer y así poder escapar del mundo del narcotráfico. Para ayudarle en esto contrata a una jóven abogada para ayudar a conseguir al Dr. que haga la operación y todo el trámite legal para crear su nueva identidad: Emilia Pérez. Después de varios años de haber fingido su muerte y de vivir con su nueva identidad, Emilia decide reconectar con su ex-esposa e hijos, asumiendo la identidad de una prima distante de Manitas Delmonte.